สมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทย ในพระบรมราชูปถัมภ์ ได้ดำเนินการปรับเปลี่ยนโครงสร้างการรับมอบสิทธิประโยชน์ของ สมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ ตามคำแนะนำของ สหพันธ์ฟุตบอลนานาชาติ (FIFA) และ สมาพันธ์ฟุตบอลแห่งเอเชีย(AFC) จาก บริษัท พรีเมียร์ลีก (ไทยแลนด์) จำกัด เป็น บริษัท ไทยลีก จำกัด
เมื่อวันที่ 29 กรกฏาคม 2559 พล.ต.อ.สมยศ พุ่มพันธุ์ม่วง นายกสมาคมฯ, นางลัขณานันท์ ลักษมีธนานันต์ และ นายยงยศ พึ่งธรรม ด้ดำเนินการจดทะเบียนจัดตั้ง บริษัท ไทยลีก จำกัด
เมื่อวันที่ 16 สิงหาคม 2559 พล.ต.อ.สมยศ พุ่มพันธุ์ม่วง ได้โอนหุ้น จำนวน 99.98 % ที่ถืออยู่ให้กับ สมาคมกีฬาฟุตบอลฯ เรียบร้อยแล้ว โดยได้จดแจ้งการโอนหุ้นลงในสมุดทะเบียนผู้ถือหุ้น และจดแจ้งต่อกรมพัฒนาธุรกิจการค้ากระทรวงพาณิชย์ เรียบร้อยแล้ว แต่ผู้ก่อตั้งอีกสองรายยังคงถือหุ้นไว้รายละ 1 หุ้น เนื่องจากกฎหมายกำหนดให้บริษัทฯ ต้องมีผู้ถือหุ้นจำนวน 3 ราย
