เวลา 16.30 น. ตามเวลาประเทศไทย ของวันที่ 26 พฤษภาคม พ.ศ.2559 สมาพันธ์ฟุตบอลเอเชีย (เอเอฟซี) จัดพิธีจับสลากแบ่งสายฟุตบอลชิงแชมป์เอเชีย 2016 รุ่นอายุไม่เกิน 16 ปี รอบสุดท้าย (AFC U-16 Championship 2016 ) ที่ รัฐกัว ประเทศอินเดีย
ทีมที่ผ่านเข้าสู่รอบสุดท้ายมีทั้งสิ้น 16 ทีม แบ่งตามโถจับสลากซึ่งยึดผลงานการแข่งขันครั้งล่าสุดเมื่อปี 2014 ได้ดังนี้
โถ 1 : อินเดีย (เจ้าภาพ) , เกาหลีเหนือ (แชมป์เก่า) ,เกาหลีใต้ (รองแชมป์เก่า) , ออสเตรเลีย
โถ 2 : อิหร่าน , มาเลเซีย , ญี่ปุ่น , อุซเบกิสถาน
โถ 3 : ไทย , ซาอุดิอารเบีย , โอมาน , เวียดนาม
โถ 4 : สหรัฐอาหรับเอมิเรตส์ , เยเมน , คีร์กิสถาน , อิรัก
ผลการจับสลากแบ่งสายการแข่งขันฟุตบอลชิงแชมป์เอเชีย รุ่นอายุไม่เกิน 16 ปี 2016
สาย A : อินเดีย , อิหร่าน , ซาอุดิอารเบีย , สหรัฐอาหรับเอมิเรตส์
สาย B : ออสเตรเลีย , ญี่ปุ่น , เวียดนาม , คีร์กิสถาน
สาย C : เกาหลีใต้ , มาเลเซีย , โอมาน , อิรัก
สาย D : เกาหลีเหนือ , อุซเบกิสถาน , ไทย , เยเมน
สำหรับ ฟุตบอลชิงแชมป์เอเชีย 2016 รุ่นอายุไม่เกิน 16 ปี รอบสุดท้าย (AFC U-16 Championship 2016 ) จะมีขึ้นระหว่างวันที่ 15 กันยายน – 2 ตุลาคม พ.ศ. 2559 ณ ประเทศอินเดีย โดยจะคัดเอา 4 ทีมที่ดีที่สุดเป็นตัวแทนทวีปเอเชียไปแข่งขันฟุตบอลเยาวชนชิงแชมป์โลก 2017 รุ่นอายุไม่เกิน 17 ปี ( FIFA U-17 World Cup 2017) ช่วงเดือน กันยายน – ตุลาคม ปี พ.ศ. 2560
ทั้งนี้ กรณีที่ อินเดีย ซึ่งเป็นเจ้าภาพในฟุตบอลเยาวชนชิงแชมป์โลก 2017 รุ่นอายุไม่เกิน 17 ปี ( FIFA U-17 World Cup 2017) ผ่านเข้าถึงรอบรองชนะเลิศด้วยนั้น จะมีการหาทีมอันดับ 5 ได้สิทธิ์เข้าไปเล่นด้วยโดยการให้ทีมที่แพ้จากรอบ 8 ทีมสุดท้าย 4 ทีม แข่งเพลย์ออฟกัน 2 รอบ
