เมืองทองยูไนเต็ดกับสนามธันเดอร์โดมนั้นเป็นของคู่กันมาตลอด แต่บางคนอาจยังไม่รู้ว่าทัพกิเลนประเดิมใช้งานสนามแห่งนี้กับการแข่งขันในระดับไทยลีก 2 เท่านั้น
ทีมฟุตบอลโรงเรียนหนองจอกพิทยานุสสรณ์ก่อตั้งเป็นสโมสรขึ้นในปี 1989 ก่อนจะเริ่มแข่งขันในฟุตบอลชิงถ้วยพระราชทานประเภท ง และเมื่อฟุตบอลลีกในเมืองไทยเริ่มก่อตั้งหนองจอกพิทยานุสสรณ์ก็เข้าร่วมการแข่งขันไทยลีกดิวิชั่น 1 ในปี 2003 โดยเปลี่ยนชื่อมาเป็นสโมสร “ ไข่มุกดำ “ และได้เมื่อเกิดการเปลี่ยนแปลงทีมงานบริหารในปีถัดมาก็เปลี่ยนชื่อมา “ โกลเบล็ก หนองจอก “ ทว่าผลงานไม่ดีจนตกชั้นกลับไปเล่นถ้วย ง ตามเดิม
อย่างไรก็ตามในปี 2006 สมาคมฟุตบอลได้ก่อตั้งไทยลีกดิวิชั่น 2 โดยผนวกเอาทีมจากถ้วยพระราชทานประเภท ข และ ค มารวมกันเพื่อเตะกันแบบลีก แล้วทีมฟุตบอลโรงเรียนหนองจอกพิทยานุสสรณ์ที่อยู่ในระดับถ้วย ง ก็ใช้เวลาอีก 1 ปีจนได้ขึ้นมาจอยลีกดิวิชั่น 2 แล้วได้ถูกบริษัท สยามสปอร์ตซินดิเคท จำกัด (มหาชน)เข้าเทคโอเวอร์อีกครั้งจนเปลี่ยนชื่อมาเป็น “ เมืองทองหนองจอกยูไนเต็ด ” พร้อมกับการหันมาใช้สนามธันเดอร์โดมเป็นรังเหย้า
วันที่ 28 เมษายน 2007 เมืองทองเปิดบ้านชนะกรมสวัสดิการทหารบก 4-2 ซึ่งถือเป็นการลงเล่นเกมเหย้าในธันเดอร์โดมครั้งแรกของเมืองทอง และเป็นหมุดหมายแรกของสโมสรตรากิเลนก่อนที่พวกเค้าเลื่อนชั้นในปีถัดมา และก้าวขึ้นมาเป็นทีมระดับแถวหน้าในฟุตบอลไทยลีกในที่สุด โดยปัจจุบันเมืองทองยูไนเต็ดคือทีมที่ได้แชมป์ไทยลีกมาสุดเป็นอันดับสองที่จำนวน 4 สมัย ส่วนสนามธันเดอร์โดมที่ถูกอัพเกรดขึ้นมาก็ยังถูกใช้ในการจัดกิจกรรมและคอนเสิร์ตศิลปินดังได้อีกด้วย
