หลังจากรอคอยมาอย่างยาวนาน ในที่สุดทีมชาติซานมาริโน่ก็ได้ลงเล่นฟุตบอลแกมแรกอย่างเป็นทางการจนได้ในปี 1990
น่าแปลกไม่น้อยที่สหพันธ์ฟุตบอลซานมาริโน่มีมาตั้งแต่ปี 1931 แต่พวกเค้าก็ไม่เคยจัดตั้งทีมฟุตบอลทีมชาติของตัวเองเลยกระทั่งปี 1986 แล้วถึงจะมีกลุ่มนักเตะทีมชาติที่ลงดวลกับทีมชาติแคนาดาชุด U-23 แต่นั่นก็ไม่ได้รับการรับรองว่าเป็นการแข่งขันอย่างเป็นทางการ เพราะทางซานมาริโน่ยังไม่ได้ลงทะเบียนเป็นสมาชิกกับทางฟีฟ่า
นักเตะซานมาริโน่จึงถูกมองว่าเป็นนักเตะอิตาลี่เนื่องจากทีมชาติของพวกเค้ายังไม่ได้รับการรับรอง แถมภูมิประเทศอิตาลี่กับซานมาริโน่ก็อยู่ติดกัน กระทั่งในปี 1988 ซานมาริโน่ตัดสินใจเข้าร่วมเป็นสมาชิกกับฟีฟ่า(และยูฟ่าด้วย) พวกเค้าจึงได้สิทธิเข้าร่วมการแข่งขันในระดับนานาชาติ
ด้วยความที่โปรแกรมคัดเลือกฟุตบอลโลก 1990 ดำเนินไปแล้ว ทำให้ซานมาริโน่ต้องรอนานถึงสองปีกว่าจะได้ลงเตะเกมทีมชาติอย่างเป็นทางการ วันที่ 14 พฤศจิกายน 1990 ซานมาริโน่ลงเล่นรอบคัดเลือกยูโร 1992 กับสวิตเซอร์แลนด์ พวกเค้าแพ้ไป 0-4 นั่นถูกบันทึกว่าเป็นเกมแรกอย่างเป็นทางการตามปฏิทินฟีฟ่าของทีมชาติซานมาริโน่
อย่างไรก็ตามจบถึงบัดนี้ซานมาริโน่ก็ยังไม่เคยเข้าร่วมทัวร์นาเมนต์ระดับเมเจอร์อย่างฟุตบอลโลกหรือฟุตบอลชิงแชมป์แห่งชาติยุโรปได้เลย ส่วนเหตุผลก็เพราะนานๆทีพวกเค้าถึงจะชนะชาติอื่นๆได้ซักครั้ง โดยมีการบันทึกไว้ว่าซานมารีโน่ชนะการแข่งขันระดับทีมชาติครั้งแรกในปี 2004 พวกเค้ามีชัยเหนือลีกเตนสไตน์ 2-1 นั่นเท่ากับว่าซานมาริโน่รอคอยชัยชนะหนแรกเป็นเวลาถึง 14 ปี(นับตั้งแต่ปี 1990)เลยทีเดียว
