หลายคนชินตากับ เอ็มบัปเป้ ในฐานะตัวชูโรงของ ปารีส แซงต์ แชร์กแมง จนอาจหลงลืมไปแล้วว่าแรกเริ่มกองหน้านินจาเต่านั้นแจ้งเกิดขึ้นมากับทีมอย่าง โมนาโก
คีลิยัน เอ็มบัปเป้ เข้ามาอยู่กับระบบเยาวชนของโมนาโก ตั้งแต่อายุ 14 และถูกจับตามองว่าจะเป็นกองหน้าอนาคตไกล เค้าประเดิมสนามกับทีมชุดใหญ่เมื่อตอนอายุ 16 ปี 347 วัน ซึ่งทำลายสถิตินักเตะอายุน้อยสุดที่ลงเล่นให้โมนาโก ของ เธียร์รี่ อองรี
แล้วเพียงฤดูกาลที่สองกับโมนาโก เค้าก็พาทีมคว้าแชมป์ได้เลย 2016/17 วันที่ 17 พฤษภาคม 2017 เอ็มบัปเป้ ทำประตูได้ในเกมชนะแซงต์ เอเตียนส์ 2-0 นั่นคือประตูที่ 15 ในลีกของเอ็มบัปเป้ ในปีนั้น สกอร์นั้นทำให้เค้าอยู่ในลิสต์ดาวซัลโวลำดับ 5 ของลีกเอิง มันถือเป็นการแจ้งเกิดที่น่าสนใจมากเพราะเอ็มบัปเป้ ที่ตอนนั้นอายุแค่ 18 ปี ได้กลายเป็นนักเตะฝรั่งเศสที่ทำประตูได้สูงสุดลำดับสองของลีกเอิง
การมีถ้วยติดมือกับโมนาโก ยิ่งทำให้เอ็มบัปเป้ ถูกจับตามอง โดยเฉพาะอย่างยิ่งปารีส แซงต์ แชร์กแมง ที่ออกตัวว่าพร้อมล่าตัวเต็มที่ หลังเปิดฤดูกาล 2017/18 หลังลงเล่นให้โมนาโก ไปแค่เกมเดียวเอ็มบัปเป้ ก็ตกลงย้ายไปร่วมทีมเปเอสเช(ยืมตัวก่อนจะซื้อขาดในเวลาต่อมา) มันทำให้โมนาโก ต้องเสียดาวยิงตัวเก่งไปแบบไม่มีเวลาตั้งตัว ดังนั้นประตูที่ยิงใส่แซงต์ เอเตียนส์ จึงกลายเป็นสกอร์สุดท้ายที่คีลิยัน เอ็มบัปเป้ ทำได้กับโมนาโก ไปโดยปริยาย โดยเค้าหยุดสถิติรับใช้โมนาโก ไว้ที่ 60 นัดยิง 27 ประตูกับ 16 แอสซิสต์